Der Kalterer See bietet mit seiner Lage eine wichtige Rast- und Ruhestätte für Vögel auf ihrem Frühjahrs- und Herbstzug. Die Besonderheit des Sees liegt darin, dass das Naturreservat eines der wenigen und der ausgedehntesten Feuchtgebiete in den Alpen darstellt. Bevor die Vögel im Frühjahr das Hindernis der Alpen in Angriff nehmen, können sie sich ein letztes Mal noch erholen und ernähren. Im Herbst hingegen bedeutet der Kalterer See die erste Möglichkeit zur Ruhe und Stärkung nach dem anstrengenden Flug über die Alpen. Außerdem findet man im Biotop südlich des Sees günstige Bedingungen für Vogelarten, die Feuchtgebiete bevorzugen. Solche Lebensräume sind in Südtirol nur mehr sehr spärlich anzutreffen und deswegen äußerst wertvoll und unbedingt zu bewahren.